Qué reproductor es?Te lo digo porque creo que el problema no es el FAT32...Ya que ese sistema se lee y escribe perfectamente en Mac. Yo tenía un Creative Zen y el fallo era que son reproductores MPD (si mal no recuerdo), es decir, que no actúan como discos duros, sino que necesitan un software para añadir/eliminar contenidos. Ese software es, por defecto, Windows Media Player, lo cual es un problema para nosotros. Yo encontré un paliativo, se llama XNJB y aunque es algo inestable, al menos no me quedé sin reproductor ni me obligó a instalar Windows sobre mac.
Si ese no es el problema, entonces ya no te puedo ayudar...
Salud!